Molegro Virtual Docker 2013.6.0.1 & Molegro Data Modeller 2013.3.0.1
- کاربرد : نرم افزار پیش بینی و مدلسازی داکینگ موکولی
- نسخه :Version 2013.3.0.1
- نوع فایل : نرم افزار
- زبان : انگلیسی
- سیستم عامل : Windows 32 & 64 Bit
- تولید کننده : CLC bio
- سال تولید : 2018
توضیحات
داکینگ (Docking) روشی است که جهت گیری ترجیحی (Preferred orientation) یک مولکول نسبت به دیگری را زمانی که به یکدیگر متصل می شوند تا کمپلکسی پایدار را شکل دهند، پیشگویی می کند یا به عبارتی روش کلیدی در پیش بینی ساختار کمپلکس رسپتور-لیگاند در فرایند کشف داروها و ترکیبات پیشرو جدید، داکینگ مولکولی نامیده می شود.
Molegro Virtual Docker نرم افزاری برای بصری سازی فرآیند داکینگ و پیش بینی تعاملات لیگاند پروتئینی است. در فرایند داکینگ، محله ی اول، مرحله نمونه گیری است که شامل ایجاد کانفورماسیون های مختلف لیگاند و بررسی جهت گیری آن ها نسبت به جایگاه فعال رسپتور است و در مرحله بعدی که امتیازدهی نامیده می شود، تمایل اتصال لیگاند به رسپتور تخمین زده می شود. در محیط گرافیکی که این نرم افزار برای کاربر فراهم می کند، می توانید تمام جنبه های فرآیند شکل گیری لیگاندهای پروتئینی از آماده سازی مولکول گرفته تا تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین مورد نظر و پیش بینی حالت اتصال لیگاندها را بررسی و مدیریت کنید.
در واقع Molegro Virtual Docker بر اساس یک روش بهینه سازی یک اتصال با کیفیت بالا و بهینه را که بر مبنای تکنولوژی ها و تکنیک های جدید، محاسبه شده است را ارائه می دهد و این در حالی است که رابط کاربری آن به گونه ای طراحی شده است تا در عین کارایی داشتن و ارائه ی نتایج پیشرفته، برای کاربرانش به راحتی قابل استفاده باشد.
قابلیت های کلیدی نرم افزار Molegro Virtual Docker:
- پیش بینی حالت اتصال لیگاندها
- دقت بالا در شناسایی درست اتصالات
- تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین
- تشخیص یک اتصال بهینه بر مبنای تکنولوژی های جدید
- رابط کاربری قابل فهم
- و ...
Molegro Virtual Docker نرم افزاری برای بصری سازی فرآیند داکینگ و پیش بینی تعاملات لیگاند پروتئینی است. در فرایند داکینگ، محله ی اول، مرحله نمونه گیری است که شامل ایجاد کانفورماسیون های مختلف لیگاند و بررسی جهت گیری آن ها نسبت به جایگاه فعال رسپتور است و در مرحله بعدی که امتیازدهی نامیده می شود، تمایل اتصال لیگاند به رسپتور تخمین زده می شود. در محیط گرافیکی که این نرم افزار برای کاربر فراهم می کند، می توانید تمام جنبه های فرآیند شکل گیری لیگاندهای پروتئینی از آماده سازی مولکول گرفته تا تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین مورد نظر و پیش بینی حالت اتصال لیگاندها را بررسی و مدیریت کنید.
در واقع Molegro Virtual Docker بر اساس یک روش بهینه سازی یک اتصال با کیفیت بالا و بهینه را که بر مبنای تکنولوژی ها و تکنیک های جدید، محاسبه شده است را ارائه می دهد و این در حالی است که رابط کاربری آن به گونه ای طراحی شده است تا در عین کارایی داشتن و ارائه ی نتایج پیشرفته، برای کاربرانش به راحتی قابل استفاده باشد.
قابلیت های کلیدی نرم افزار Molegro Virtual Docker:
- پیش بینی حالت اتصال لیگاندها
- دقت بالا در شناسایی درست اتصالات
- تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین
- تشخیص یک اتصال بهینه بر مبنای تکنولوژی های جدید
- رابط کاربری قابل فهم
- و ...
Description
Molegro Virtual Docker is an integrated platform for predicting protein ligand interactions. Molegro Virtual Docker handles all aspects of the docking process from preparation of the molecules to determination of the potential binding sites of the target protein, and prediction of the binding modes of the ligands.
Molegro Virtual Docker offers high-quality docking based on a novel optimization technique combined with a user interface experience focusing on usability and productivity.
The Molegro Virtual Docker (MVD) has been shown to yield higher docking accuracy than other state-of-the-art docking products (MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%).
Molegro Virtual Docker provides:
- High docking accuracy: the docking engine has been proven to correctly identify binding modes with high accuracy. Molegro Virtual Docker has been shown to outperform other docking programs with regard to identification of correct binding modes (see the technology pages for more information).
- Easy-to-use interface: the built-in wizards enable the user to easily setup and perform docking runs. Advanced visualization and analysis tools are provided to examine ligand-receptor interactions and fine-tune found docking solutions.
- Cross-platform: supported on Linux, Windows and Mac, allowing easy interoperability between platforms.
More info (open/close)
Molegro Virtual Docker offers high-quality docking based on a novel optimization technique combined with a user interface experience focusing on usability and productivity.
The Molegro Virtual Docker (MVD) has been shown to yield higher docking accuracy than other state-of-the-art docking products (MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%).
Molegro Virtual Docker provides:
- High docking accuracy: the docking engine has been proven to correctly identify binding modes with high accuracy. Molegro Virtual Docker has been shown to outperform other docking programs with regard to identification of correct binding modes (see the technology pages for more information).
- Easy-to-use interface: the built-in wizards enable the user to easily setup and perform docking runs. Advanced visualization and analysis tools are provided to examine ligand-receptor interactions and fine-tune found docking solutions.
- Cross-platform: supported on Linux, Windows and Mac, allowing easy interoperability between platforms.
More info (open/close)
برای اطلاع از طریقه نصب به فایل How to Install.txt رجوع شود.
