ارزیابی روش های استخراج کلاژن برای تحلیل ایزوتوپ های پایدار در مطالعات رژیم غذایی / Evaluating bone collagen extraction methods for stable isotope analysis in dietary studies

ارزیابی روش های استخراج کلاژن برای تحلیل ایزوتوپ های پایدار در مطالعات رژیم غذایی Evaluating bone collagen extraction methods for stable isotope analysis in dietary studies

  • نوع فایل : کتاب
  • زبان : فارسی
  • ناشر : الزویر Elsevier

توضیحات

چاپ شده در مجله علوم باستان شناسی – Journal of Archaeological Science
رشته های مرتبط باستان شناسی
۱-مقدمه تحلیل‌های ایزوتوپ پایدار δ۱۳C و δ۱۳N اندازه گیری شده در کلاژن استخوان معمولاً برای بازسازی الگوهای رژیم غذایی و معیشت باستان استفاده می‌شوند (امبروز ۱۹۹۳، باکرنز و همکاران ۲۰۰۶، هانچ و همکاران ۲۰۰۶، جی و ریچاردز ۲۰۰۶، کاتنزبر ۲۰۰۰، ریچاردز و همکاران ۱۹۹۸). برای تولید نمونه‌های استخوانی برای تحلیل ایزوتوپ، روش‌های متعددی توسعه یافته است. بیشتر این روش‌ها، عواملی نظیر هومیک اسید و لیپیدهایی که می‌توانند بر صحت (تکرار پذیرِ) اندازه گیری‌ها اثر بگذارند را در نظر می‌گیرند (برانک رامزی و همکاران ۲۰۰۴، براون و همکاران ۱۹۹۸، کولینز و گالی ۱۹۹۸، گاروی ولاک و همکاران ۲۰۰۴، لیدن و همکاران ۱۹۹۵، نیلسن مارش و هدچ ۲۰۰۰، سمال و اربان ۱۹۹۵). به طور کلی بر طبق گفته لانگین (۱۹۷۹)، روش‌های استخراج شامل انحلال ماتریس معدنی در یک محلول HCL، انحلال پذیری کلاژن در دمای بالا در محلول HCL ضعیف و سپس روش خشک کردن انجمادی کلاژن باقی مانده استفاده شد. با این حال، اصلاحات متعددی از جمله افزودن یک مرحله تیماری با NAOH برای حذف هومیک اسید قبل از انحلال پذیری کلاژن (دنیرو و اپشتین ۱۹۸۱) و یا استفاده از اولترافیلتراسیون برای تخلیص کلاژن محلول وجود دارد (براون و همکاران ۱۹۸۸). این توصیه‌ها معمولاً موسوم به مراحل پاک سازی برای اندازه گیری کلاژن اصلی مورد استفاده در مطالعات رژیم غذایی می‌باشند. رویکردهای شیمیایی متنوعی در تهیه نمونه‌های مورد استفاده توسط ازمایشگاه های ایزوتوپ پایدار متفاوت وجود دارد. با این حال، صرف نظر از مراحل، ازمایشگاه ها از نتایج یک دیگر به صورت منابع و مقایسه در مطالعات رژیم غذایی استفاده می‌کنند (بیلیس و همکاران ۲۰۰۴، جورکوف ۲۰۰۲، کیگان ۱۹۸۹). مطالعات قبلی بر روی این روش‌های استخراج به بررسی اثرات اولترافیلتراسیون در سن یابی رادیوکربن و تأثیر لیپیدها بر روی مقادیر ایزوتوپ کربنی پایدار (برانک رامزی و همکاران ۲۰۰۴، لیدن وهمکاران ۱۹۹۵) پرداخته‌اند. نتایج نشانداده است که اولترافیلتراسیون موجب می‌شود تا ذرات الاینده بزرگ‌تر باقی بمانند و لپیید ها موجب تغییر سیگنال‌های کربن می‌شوند. از این روی بررسی این که آیا روش‌های استخراج و مراحل پاک سازی بر نتایج ایزوتوپی و تفسیر تغییرات رژیم غذایی تأثیر می‌گذارند یا خیر، لازم است. هدف ویژه این مطالعه مقایسه سه روش تهیه نمونه بر روی مواد اسکلتی حفاظت شده با ارزیابی تفاوت‌های حاصله در δ۱۳C و δ۱۳N ، کیفیت کلاژن و عملکرد کلاژن می‌باشد. اولین روش A شامل تیمار با NaOH، دومین روش B شامل هر دو اولترافیلتراسیون و فیلتراسیون با فیلترهای جداکننده Ezee(5-8 میکرومتر) قبل از خشک کردن انجمادی توصیف شده توسط ریچارد و هدج (۱۹۹۹) و مالدنر و ریچارد (۲۰۰۵) می‌باشد. سومین روش (C) نسخه اصلاحشده روش B با حذف مرحله اولترافیلتراسیون می‌باشد. این نسخه اصلاح شده روش B در ازمایشگاه های تحلیل ایزوتوپ پایدار با استفاده از مطالعات رژیم غذایی استفاده می‌شود (هانچ و همکاران ۲۰۰۶). ۲-مواد و روش‌ها نمونه‌های استخوانی انتخاب شده برای این مطالعه، از یک مجموعه اسکلتی مشخص از گورستان قرون وسطی Ahlgade 15e17 در هالبک دانمارک (ازموسن ۱۹۹۷) جمع اوری شد. گورستان بین ۱۱۰۰-۱۵۷۳ پس از میلاد استفادهشده و دارای بیش از ۷۰۰ اسکلت مدفون در خاک رس است. این مواد به دلیل وضعیت حفاظتی عالی خود انتخاب شدند (استخوان‌ها از نظر ماکروسکوپی با ساختارهای سخت سالم باقی مانده بودند). هشت نمونه استخوانی از پنج نفر با سه روش استخراج، استخراج شد. جزییات مربوط به نمونه‌ها، از جمله سن و جنسیت افراد در جدول ۱ نشان داده شده است.

Description

۱٫ Introduction Stable isotope analyses of d13C and d15N measured in bone collagen are routinely used for the reconstruction of ancient diets and subsistence patterns (e.g., Ambrose, 1993; Bocherens et al., 2006; Honch et al., 2006; Jay and Richards, 2006; Katzenberg, 2000; Richards et al., 1998). Several techniques have been developed to prepare bone samples for isotope analysis. Most of these consider and adjust for factors such as humic acids and lipids that might influence the reproducibility of the measurements (Bronk Ramsey et al., 2004; Brown et al., 1988; Collins and Galley, 1998; Garvie-Lok et al., 2004; Lide´n et al., 1995; Nielsen-Marsh and Hedges, 2000; Semal and Orban, 1995). Generally, following Longin (1971), the extraction methods involve dissolving the mineral matrix in a HCl solution, subsequent solubilisation of collagen at elevated temperature in a weak HCl solution, followed by lyophilisation of the remaining collagen. However, there are various modifications including the addition of a treatment step with NaOH to remove humic acids before solubilisation of the collagen (DeNiro and Epstein, 1981), or the use of ultra-filtration to purify the solubilised collagen (Brown et al., 1988). These recommendations are commonly applied as cleaning steps in order to measure the original collagen used in dietary studies. There are diverse chemical approaches in sample preparation used by different stable isotope laboratories. However, whatever the steps, the laboratories use each others results as references and comparison in dietary studies (e.g. Bayliss et al., 2004; Jørkov, 2002; Keegan, 1989). Previous studies of these extraction methods have examined the effects of ultra filtration in radiocarbon-dating and the contribution of lipids on the stable carbon isotope values (e.g. Bronk Ramsey et al., 2004; Lide´n et al., 1995). Results have shown that ultra-filtration may still leave larger contaminating particles and lipids may alter the carbon signals. We therefore thought it necessary to investigate whether the extraction methods and cleaning steps may influence the isotopic result and hence potentially the interpretation of dietary variation. The specific purpose of this study was to compare three sample preparation methods on well-preserved skeletal material by evaluating the resultant differences in d13C and d15N, collagen quality and collagen yield. The first method (A) includes the treatment with NaOH, the second method (B) includes both ultra-filtration and filtration with Ezee filter separators (5e8 mm) (Elkay Laboratory Product) before lyophilisation as described in Richards and Hedges (1999) and Mu¨ldner and Richards (2005). The third method (C) is a modified version of method B, by excluding the ultra-filtration step. This modified version of method B is also used in laboratories conducting stable isotope analysis in dietary studies (Honch et al., 2006). ۲٫ Materials and methods The bone samples selected for this study were chosen from a large well documented skeletal collection from the medieval cemetery Ahlgade 15e17 in Holbæk, Denmark (Asmussen, 1997). The cemetery was used between ca. 1100e1573 AD, and contained more than 700 skeletons buried in clay soil. The material was chosen because of its excellent state of preservation (the bones were macroscopically intact with a hard structure and feel (i.e. non-flaky)). Eight bone samples from five individuals were each treated with the three extraction methods. Details on the samples, including age and sex of the individuals are given in Table 1.
اگر شما نسبت به این اثر یا عنوان محق هستید، لطفا از طریق "بخش تماس با ما" با ما تماس بگیرید و برای اطلاعات بیشتر، صفحه قوانین و مقررات را مطالعه نمایید.

دیدگاه کاربران


لطفا در این قسمت فقط نظر شخصی در مورد این عنوان را وارد نمایید و در صورتیکه مشکلی با دانلود یا استفاده از این فایل دارید در صفحه کاربری تیکت ثبت کنید.

بارگزاری